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ホルムアルデヒド含有アガロースゲルを用いたRNAの電気泳動

使用例3

ホルムアルデヒド含有アガロースゲルを用いたＲＮＡの電気泳動

試薬	10×MESA、Agarose、Formamide、*Formaldehyde solution、Ethidium bromide、Bromophenol blue、Xylenecyanol FF、Glycerol (*Formaldehydeの蒸気は毒性を有するので、取り扱いはフード内で行います）
方法	EB溶液作製	Ethidium bromideを0.5mg/mlになるように溶解させ、冷暗所で保存します。
	色素マーカー	0.2mg/ml Bromophenol blue、0.2mg/ml Xylenecyanol FF、62.5% Formamide、1.14M Formaldehyde solution、1.25×MESAになるように溶解させます。

ゲルの作製　(12% Acrylamide の場合)

1. Agaroseに68mlの精製水を添加し、電子レンジなどで加温溶解します。
   注：突沸する恐れがあるので注意します。また溶け残りがないことを確認します。
2. 液温が60℃程度に下がったら、0.5μg/mlになるように前もって作製したEB溶液を添加します。
3. 電気泳動ゲルの型からゲルが流れ落ちないように、テープで型の両端を貼ります。
   （Agarose溶液を入れた時、漏れないようにパスツールピペットでテープと型との境目をAgarose溶液でシールします。）
4. コームを差し、境目のAgaroseが固定したら、残りのAgarose溶液を型に流し込みます。
5. 固化したことを確認した後、コームを静かに引き抜き、テープを剥がします。

電気泳動

1. 電気泳動の泳動バッファーも10×MESAを用いる。10×MESA 100ml を精製水で1Lにします。
2. 作製したゲルを泳動槽に装着し、泳動バッファーを流し込みます。
3. サンプルと色素マーカーを5：1の割合で混和し、ゲルのスロットに注入します。
4. 定電圧で電気泳動を実行します。
5. 色素の泳動距離を目安にし泳動を終えます。
6. DNAのバンドの確認はUVを照射して行います。

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