DNAの電気泳動(1kb以下)
使用例2
DNAの電気泳動(1kb以下)
| 試薬 | 10×TBE、Acrylamide、N,N'-Methylene-bisacrylamide、Ammonium peroxodisulfate、Ethidium bromide、Bromophenol blue、Xylenecyanol FF、Glycerol | |
|---|---|---|
| 方法 | EB溶液作製 | Ethidium bromideを0.5mg/mlになるように溶解させ、冷暗所で保存します。 |
| 色素マーカー | 0.25% Bromophenol blue、0.25% Xylenecyanol FF、30% Glycerol になるように溶解させます。 | |
ゲルの作製 (12% Acrylamide の場合)
- 0% Acrylamide溶液
29gのAcrylamide,monomerと1gのN,N'-Methylene-bisacrylamideを精製水100mlに溶解させ、ストック溶液として冷蔵保存します。 - 10% Ammonium peroxodisulfate溶液
精製水で10%溶液を調製します。用時調製してください。 - スラブ電気泳動用のガラス板をよく洗浄しておき、組み立てておきます。
- 30% Acrylamide溶液40ml、10% Ammonium peroxodisulfate溶液0.5ml、10×TBE 10mlを添加し、精製水で全量100mlにします。
- 0.5mg/mlになるように前もって作製したEB溶液を添加します。
- TEMED 15μlを添加し、電気泳動の型に流し込みます。
- コームを差し、室温に放置し、固化させます。固化したことを確認した後、コームを静かに引き抜きます。
Acrylamide濃度と有効な分離能の得られるDNAの関係
| Acrylamide(%) | DNA |
|---|---|
| 3.5 | 100~1000 |
| 5.0 | 80~500 |
| 8.0 | 60~400 |
| 12.0 | 20~200 |
| 20.0 | 10~100 |
電気泳動
- 電気泳動の泳動バッファーも10×TBEを用いる。10×TBE 100ml を精製水で1Lにします。
- 作製したゲルを泳動槽に装着し、泳動バッファーを流し込みます。
- サンプルと色素マーカーを5:1の割合で混和し、ゲルのスロットに注入します。
- 定電圧で電気泳動を実行します。
- 色素の泳動距離を目安にし泳動を終えます。
- DNAのバンドの確認はUVを照射して行います。

























