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DNAの電気泳動(1kb以下)

使用例2

DNAの電気泳動(1kb以下)

試薬 10×TBE、Acrylamide、N,N'-Methylene-bisacrylamide、Ammonium peroxodisulfate、Ethidium bromide、Bromophenol blue、Xylenecyanol FF、Glycerol
方法 EB溶液作製 Ethidium bromideを0.5mg/mlになるように溶解させ、冷暗所で保存します。
色素マーカー 0.25% Bromophenol blue、0.25% Xylenecyanol FF、30% Glycerol になるように溶解させます。

ゲルの作製 (12% Acrylamide の場合)

  1. 0% Acrylamide溶液
    29gのAcrylamide,monomerと1gのN,N'-Methylene-bisacrylamideを精製水100mlに溶解させ、ストック溶液として冷蔵保存します。
  2. 10% Ammonium peroxodisulfate溶液
    精製水で10%溶液を調製します。用時調製してください。
  3. スラブ電気泳動用のガラス板をよく洗浄しておき、組み立てておきます。
  4. 30% Acrylamide溶液40ml、10% Ammonium peroxodisulfate溶液0.5ml、10×TBE 10mlを添加し、精製水で全量100mlにします。
  5. 0.5mg/mlになるように前もって作製したEB溶液を添加します。
  6. TEMED 15μlを添加し、電気泳動の型に流し込みます。
  7. コームを差し、室温に放置し、固化させます。固化したことを確認した後、コームを静かに引き抜きます。

Acrylamide濃度と有効な分離能の得られるDNAの関係

Acrylamide(%) DNA
3.5 100~1000
5.0 80~500
8.0 60~400
12.0 20~200
20.0 10~100

電気泳動

  1. 電気泳動の泳動バッファーも10×TBEを用いる。10×TBE 100ml を精製水で1Lにします。
  2. 作製したゲルを泳動槽に装着し、泳動バッファーを流し込みます。
  3. サンプルと色素マーカーを5:1の割合で混和し、ゲルのスロットに注入します。
  4. 定電圧で電気泳動を実行します。
  5. 色素の泳動距離を目安にし泳動を終えます。
  6. DNAのバンドの確認はUVを照射して行います。

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